NGS секвенатор Ion Torrent Ion GeneStudio ™ S5 Prime System

Каталожный номер
A38412
Производитель
Производительность
от 2 до 260 миллионов прочтений
Рейтинг 5
цена по запросу

Описание

Секвенатор Ion GeneStudio S5 Prime System - самый высокопроизводительный секвенатор с возможностью анализа до 50 Гб данных в день (260 млн прочтений), на основе полупроводников (NGS) определяется последовательность ДНК методом основанным на обнаружении ионов водорода, которые выделяются во время полимеризации ДНК при этом изменяется уровень pH в ячейке чипа. Цикл за циклом прибор детектирует и документирует эти изменения, напрямую оцифровывая биологическую молекулу ДНК. Секвенирование происходит на чипе, который содержит десятки миллионов ячеек, реакция в которых проходит параллельно, что позволяет за короткое время получить большой объем информации.
Эта технология отличается от других технологий секвенирования тем, что не использует модифицированные нуклеотиды и оптические датчики. Комбинация полупроводниковых микрочипов и природной биохимии позволяет напрямую переводить биологическую информацию в цифровой вид. Секвенаторы Ion Torrent компактные и экономичные, с небольшой стоимостью прогона, по сравнению  с другими производителями, подходят многим лабораториям как профессиональные системы. 

Прибор Ion GeneStudio S5 Prime работает с чипами различной емкости: Ion 510™, Ion 520™, Ion 530™, Ion 540™ и Ion 550™,
что позволяет в день получать от 2 до 260 миллионов прочтений (2 чипа Ion 550™).

Приблизительное время работы инструмента Ion GeneStudio S5 для заданного типа микросхемы, длины чтения и количества чтений показаны в следующей таблице. Время выполнения показывает типичное время от запуска до доставки файла BAM (1 запуск / инициализация).


 

 

Тип чипа

 

Количество 

прочтений

 млн      

 

Длина прочтения 

(выход)

Время секвенирования и анализа (суммарно) часов

Ion GeneStudio S5

 Sequencer

Ion GeneStudio S5 

Plus Sequencer

Ion GeneStudio S5

 Prime Sequencer

 

 

Ion 510™ Chip

 

 

2–3

200 п.н.

0.3–0.5 Gb

 

          4.5

 

3

 

3

400 п.н.

0.6–1 Gb

 

         10.5

              

               5

              

               5

 

 

Ion 520™ Chip

 

 

4–6

200 п.н.

0.6–1 Gb

 

          7.5

 

            3.5

 

3

400 п.н.

1.2–2 Gb

 

           12

 

            5.5

 

             5.5

 

3–4

600 п.н.

0.5–1.5 Gb

 

           12

 

           5.5

 

            5.5

 

 

 

Ion 530™ Chip

 

 

15–20

200 п.н.

3–4 Gb

 

         10.5

     

             5

 

4

400 п.н.

6–8 Gb

 

         21.5

      

             8

 

             6.5

 

9–12

600 п.н.

1.5–4.5 Gb

 

          21

      

             8

 

7

Ion 540™ Chip

 

60–80

200 п.н.

10–15 Gb

 

          19

 

           10

 

            6.5

Ion 550™ Chip

 

100–130

200п.н.

20–25 Gb

 

 

          11.5

 

            8.5



Подбор чипов исходя из количества и вида образцов, которые вам нужно запустить, и
вывод данных, оптимальный для вашего приложения.


Тип чипа                                                                   

 Ion 510™

Ion 520™

Ion 530™

Ion 540™

Ion 550™

Максимальная производительность (прочтения) млн

3         

6

20

80

130

Таргетное секвенирование ДНК

 Ion Torrent™ Oncomine™ Focus Assay

 

 

 

 

 

Секвенирование малых геномов

(например, типирование бактерий с помощью

 Ion Xpress™ Plus Fragment Library Kit)

 

 

 

 

 

 

 

Секвенирование 16S рРНК (метагеномика)

(например, Ion 16S™ Metagenomics Kit)

 

 

 

 

 

Секвенирование экзома

(например, Ion AmpliSeq™ Exome Panel)

 

 

 

 

 

Таргетное секвенирование РНК

(например, Ion AmpliSeq™ made-to-order RNA panels)

 

 

 

 

 

Профилирование микро/малых РНК

(например, Ion Total RNA-Seq v2 Kit)

 

 

 

 

 

Таргетное секвенирование транскриптома

(например, Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit)

 

 

 

 

 

 

 

Секвенирование полного траснкриптома

(например, Ion Total RNA-Seq v2 Kit)

 

 

 

 

 

Преимплантационный генетический скрининг (ПГС) 

(например, Ion ReproSeq™ PGS Kit)

 

 

 

 

 


Характеристики

Первичный анализ данных
Torrent Suite
Вторичный анализ данных, аннотация
Ion Reporter™
Форматы выходных данных
FASTQ, BAM, SFF, VCF
Число образцов, одновременно секвенируемых за 1 запуск прибора
1 - 384
Совместимость с чипами
on 510™, Ion 520™, Ion 530™, Ion 540™, Ion 550™
Максимальная пропускная способность / день (тип чипа)
50 Gb (чипы 2 иона 550)
Cкорость
6,5 часов (чип Ion 540) 8,5 часа (чип Ion 550)
Объём памяти сервера
25 ТБ
Производительность
от 2 до 260 миллионов прочтений
Вес основного блока
63,5 кг
Размеры основного блока (Ш х Г х В)
542 х 806 х 509 мм

Отзывы

На этот товар нет ни одного отзыва

Добавьте отзыв:

Если вы хотите задать вопрос по товару или сделать заказ, просьба обращаться через форму запроса КП, по электронной почте info@laboratorii.com или по контактным телефонам.